Все просто. Меняем табуляцию на пробел

txt = document.getElementById('ИД вашего textarea').value;
txt = txt.replace(/(\t)/g," "); 

Другой пример
Надо заменить

\r\n

на

<br />

Выглядит пример так

txt = txt.replace(/(\r\n)/g,"<br />");